菏泽市中医院建院于1975年，是菏泽市一家三级甲等医院。经过多20年的发展壮大现已成为全市中医药医疗、教学、、康复中心，是山东中医药大学和菏泽医专、曲阜中医药学校的教学医院。1991年被省卫生厅确定为地市级示范中医院建设单位，1995年被省卫生厅、地区卫生局评为职业道德建设单位，1996年12月被国家中医药管理局评定三级甲等中医院。1998年经地区卫生局批准加挂菏泽地区中西医结合医院的牌子，1998年还被评为爱婴医院，成为名副其实的中医、西医、中西医结合的较大型综合医院，为全区的中医药发展起着龙头带动作用。

菏泽中医院地理位置优越，位于菏泽市开发区内，属菏泽新城中心，距菏泽市政府、市委仅200米，医院占地面积44662.2平方米（67亩），建筑面积18600平方米，开设病床260张，家庭病床40张，规模越来越大。医院现有正式职工382人，在编卫技人员中具有副以上职称者50多人，主治医师职称者85人，初级职称者173人。医院设置了比较齐备的医疗科室，（内、外、妇、儿、中风、保健、针灸、推拿、痔瘘、五官、新疗、急诊、口腔、美容、分院等）在治疗中风、颈肩腰腿疼、眼病、肝胆病、糖尿病、结石病等方面颇具特色。

医院为提高医疗水平，购置了一批的医疗设备，体外震波碎石机，多功能旋转式牵引床，彩色B超机，全自动中药煎药包装机等，价值1400多万元。

医院创建了科室如颈肩腰腿疼治疗中心、肝病研究中心等。同时社会各界对菏泽中医院的医德、医风有口皆碑。