医院专科设置齐全,设有44个临床医技科室,拥有省部级重点学科1个(全科医学科)、省部级医学重点学科1个(全科医学科)、省部级重点实验室1个(脑血管病研究实验室)、省部级临床重点专科5个(神经外科、神经内科、儿科、呼吸内科、肿瘤内科),省部级医疗特色专科2个(骨科-脊柱、眼科),是重庆医科大学临床医学博士后流动站、重庆市博士后工作站。医院开展院内学科建设,重点建设临床专科10个(心血管内科、普通外科等)、特色医疗专科15个(烧伤、消化、核医学等)
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