南京蓝旗医院有精诚团结的领导班子，有一支精明强干的医院队伍，全院五十名职工，仅高、中级医务人员有十八名。现共有病床二十张。曾多次被上级政府、主管部门评为、文明、立功单位。

南京蓝旗医院服务宗旨是“病员第一”“质量第一”并恪守医德、医风，确保医疗质量，严格规章制度争创服务，并在全院上下倡导把一颗热心、爱心、诚心，奉献给广大病员。

本院以皮肤科、眼科、泌尿专科为特色专科。医院设有内儿科、外科、口腔科、妇科、五官科、老年科、精神科、家床科、针灸理疗科、防保科、妇、儿保科、放射科、体验室、医疗美容科、心电图室、脑血流室、B超室、开设了冷冻、光疗、激光、微波治疗等项目。