福建中医学院附属第二人民医院创建于1990年，又名福建省第二人民医院，福建中医学院第二临床医学院。经过十多年的发展，已成为集医疗、教学和为一体的综合性中医医院。

医院临床科室齐全，脾胃、康复、心力衰竭、中西医结合脑血管病为福建省中医重点专科。体检中心、康复中心、血液净化中心跻身省内医疗特色专业。中医骨伤病学专业也是我省"211"工程的中医临床重点学科。肿瘤、泌尿、肛肠、乳腺、颈椎病、老年医学、肝胆外科、医学美容、微创、介入、影像等专业的诊疗技术也有突出的优势。近年来，在坚持中医特色与优势的同时，开展了大量的新技术、新项目，其中肝移植、肾移植、角膜移植手术的例数及均达省内水平，13公斤以下儿童肾移植。肝胆结石镜下取石治疗手术、逆行性胰胆管造影（ERCP）、腹腔镜、宫腔镜、关节镜、泌尿系结石和前列腺疾病的腔镜、心脏及外周血管介入治疗、消化道肿瘤、肿瘤围手术期中药治疗等技术已达到国内水平。