创立于1908年，前身为“义德医院”，由美国基督教南长老会传教士、医学博士慕庚扬创办。医院为三级甲等综合性医院，担负着医疗、教学、、预防、保健、康复、等7项中心任务以及政府指令性任务和突发公共卫生事件应急救治任务。同时承担着连云港市肿瘤医院、连云港市临床肿瘤研究所和连云港市慈善医院职能。依托医院工作，建立了连云港市互联网医院、连云港市安宁疗护中心、连云港市老年医学中心及连云港市医养结合培训基地、连云港市癌症中心。目前拥有东西两个院区，占地132亩，建筑面积11.1万平方米，核定床位1307张，设有61个(一、二、三级)临床医技科室，36个病区。连云港市第二人民医院为南京医科大学康达学院附属医院、蚌埠医学院临床学院、江苏大学临床学院、徐州医科大学临床学院，南京医科大学、天津医科大学等十家医学院校教学医院。是国家药物临床试验机构，住院医师规范化培训基地，江苏省全科医师规范化培训基地。是全国百姓放心示范医院、江苏省实施患者安全目标合格医院，江苏省癌症康复指导和随访管理示范机构，美国微笑列车“先天性唇腭裂修复项目合作医院”，江苏省人民医院战略合作医院，江苏省肿瘤医院技术支持合作医院。