医院前身是长春市传染病医院1934年建院，在医院发展72年历程中，积累了大量宝贵的临床治疗经验，先后开展了专家远程会诊、肝病国际标准试剂检测、肝肿瘤治疗、乙肝特异性主动免疫疗法、三环三联中医疗法、腹水浓缩回输术、乙肝病毒母婴传播阻断技术，人工肝支持系统、脂肪肝酒精肝检测预报系统等是国内、省内性特色项目，另外在治疗痢疾肠炎、出血热、麻疹、猩红热等传染疾病方面有独特经验。先后荣获省、市《百姓满意医院》、《白求恩杯单位》、《省精神文明单位》和《百家医院联评》第一名等多项殊荣。

2004年经国家批准，正式更名为吉林北方肝胆医院。医院现占地面积28000平方米，建筑面积24000平方米。集医疗、教学、于一体，技术力量雄厚，有多项成果获省、市科技进步奖。其中卫生技术人员近400人，拥有以吉林省传染病学会副主任委员、“长春”苗永年主任医师为代表的职称专业技术人员77人。现设肝胆外科疗区、感染综合疗区、肝病内科疗区和脂肪肝疗区，并设有室和药剂、检验、影像、电诊、净化中心等辅助科室。开设床位500张，拥有大型西门子CT机、多普勒彩色超声诊断仪、全自动生化分析仪、多功能消化道电子胃镜、DSA介入治疗系统的医疗设备42台件。其中雅培全自动免疫分析系统和全自动荧光定量PCR检测分析仪，采用国际标准试剂，结果达到国际认可标准，通过国家认证。是吉林省能够完成肝炎病毒定量分析的机构。

十几年来，医院坚持走肝病专科建设发展之路，与全国多家大型综合性医院建立了技术协作关系，形成了多项省内项目，为肝病患者建立了肝病专家会诊中心、肝病检测中心等为的肝病诊疗平台。

医院肝胆外科在现有肝病专家的基础上，确立和巩固了吉林省肝病专科医院在肝胆外科领域的优势地位。目前，已完成肝叶切除术452例，门脉高压症手术病例占长春地区总数的二分之一以上，胆道疾病施行微创手术已逾千例，在省内形成技术优势，在肝脏手术的实例上省内。同时，形成了以肝癌、肝硬化及门脉高压症治疗为特色，以肝移植、肝细胞移植、脏器移植为发展方向的现代化的外科治疗格局。

医院在发展创新建设中始终坚持“以患者为中心”、“救死扶伤”、“服务人民”的建院方针和服务理念，不断实行平民化、大众化、低价位基本医疗服务，用良好的服务质量回报人民群众的厚爱。