航空总医院成立于1972年，隶属于世界五百强企业——中国航空工业集团公司，历经四十余年发展，医院已成为集医疗、教学、、预防为一体的大型公立三级综合医院、航空工业医疗行业龙头医院、北京市北苑地区医疗中心、联合国儿童基金会和国家卫计委联合授予的“爱婴医院”、中国医院授予的 “全国百姓放心示范医院”、北京市卫生局授予的“平安医院”、北京市社会医疗保险定点医疗机构、全国无烟医院、中国医科大学非直属附属医院、北京中医药大学和四川大学华西口腔医学院教学医院。

医院拥有一个总部、四个门诊部和四个社区服务站，专业设置齐全，下设47个临床、医技科室。有现代化的洁净手术部、重症医学科、静脉输液配置中心和辐射全国的大型健康管理中心，是“中华妇科肿瘤疑难会诊中心”，设有北京急救中心北苑急救站。承担着中国航空工业集团公司50万员工的职业病防治、医疗保健工作，肩负着大型飞行试验的医疗和周边100余万居民的医疗保健任务。

医院占地面积约28600平方米，建筑面积73075平方米，南区建设将新增医疗用房4.6万平方米，建成后，医院建筑面积将达12万平方米。现编制床位1000张。