黑龙江中医药大学附属第二医院前身是成立于1963年的黑龙江中医学院附属医院第一门诊部，1992年成立黑龙江中医学院附属第二医院， 1997年更名为“黑龙江中医药大学针灸推拿学院暨附属第二医院”。2011年黑龙江中医药大学康复医学院成立，落户本院。黑龙江中医药大学第二临床医学院针灸推拿学院康复医学院暨附属第二医院是一所集医疗、教学、于一体，突出针灸、推拿、康复特色的综合性三级甲等中医医院。
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食管、胃、肠等消化管，肝、胆、胰、脾等消化腺及腹膜的急危重患和疑难病例有较高的诊治率；用胃肠镜，介入导管等现代设备开展国内外一流水平的诊疗。
斜、弱视，屈光不正的诊断治疗。
研究方向为肿瘤麻醉与围术期创伤、心理应激与免疫功能和认知功能的保护。
甲状腺、心血管疾病（如：冠心病、心肌梗塞、心肌缺血）、脑血管疾病（如：脑梗塞、癫痫、痴呆、脑积水）、肿瘤的核医学影像诊断及治疗。
脑肿瘤的外科治疗，颈椎病和腰椎间盘突出症外科治疗。
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