邳州市妇幼保健所始建于1953年，是全市一家为妇女儿童提供医疗保健服务的全民事业医疗机构，担负着全市基层妇幼卫生工作的监督、质控、指导、培训及全市妇女儿童医疗保健、重大妇幼卫生工作和基本妇幼卫生工作的重任。同时，承担全市《出生医学证明》发放、管理、新生儿疾病筛查、产前筛查等工作。经市委市政府多方协调，在卫生局领导关怀下，原市人民医院城东分院划归妇幼保健所使用，新址位于瑞兴路与万兴路交叉路口处，2012年5月26日，妇幼保健所与市人民医院顺利完成交接，经简单修缮，于2012年6月20日全所整体搬迁至新址开诊营业。新址占地面积6666平方米，建筑面积2081平方米，现有在职职工46人，卫生技术人员35人；其中职称2人，中级职称13人，初级职称10人。