目前，医院有职称27人，占8.2%，中级职称99人，占30.1%，兼职副教授、讲师32名；全院开放病床100多张，年门诊56.5次。临床科室设置齐全，有急诊科、内科、外科、骨伤科、儿科、妇产科、消化科、五官科、康复理疗科等，并设有骨伤、肝肾、心脑血管病、康复理疗、肛肠病、糖尿病等多个优势专科。医院还开展家庭病床、社区康复、老年护理、慢性病建档跟踪、社区健康促进等社区卫生服务，深受群众欢迎。

医院努力发挥中医治疗优势，采用中西医结合方法治疗各种危重病和疑难疾病，如心脑血管病、糖尿病、早期肝硬化、急慢性肾炎、前列腺疾病等；并开展各类重建钢板的内固定术、人工髋（膝）关节置换术、微创泌尿外科技术和PPH、性疗法治疗肛肠疾病等国内新技术，收到较好的效果。引进和开发康复理疗新技术治疗各种脊柱病、中风后遗症等，其中让一位70多岁高位截瘫长达7个多月的老伯恢复行走，创造了三水区中医院历史上的奇迹。

为满足人民群众日益提高的医疗保健需求，改善诊疗环境，在三水区委、区政府的支持下，将区人民医院旧址划给区中医院使用。2005年10月13日，区政府将区中医院(含区人民医院旧址)全部资产无偿划拨给佛山市中医院，用于医疗卫生服务，佛山市中医院接收区中医院的人、财、物。区中医院同时更名为“佛山市中医院三水分院”。分院为佛山市中医院分支机构，是政府所属非营利性医疗机构，是社会性事业单位，其基本中医服务等功能不变。佛山市中医院负责分院及属下13个分支站点的投资、建设和管理，并根据三水区卫生事业发展状况及医院的发展战略制定分院今后的发展规划，对三水区人民医院旧址按二级甲等中医院标准要求重新布局、分期进行投资改造，对分院所属的13个分支站点也重新布局和改造，使之成为具有规模的佛山市中医院分院。佛山市中医院享有分院的财产支配权、经营管理权及相关的民事权利，承担分院相应的义务和责任，分院今后的单位性质、经营方式和资产处置等与总院保持一致。新设立的三水分院为佛山市中医院分支机构，按二级甲等医院建制，分院独立核算、自主经营、自负盈亏。佛山市中医院徐志强任三水分院院长、余俊文任副院长，原区中医院陈维强、黄雄任副院长。

整合后，佛山市中医院三水分院坚持“以病人为中心”的宗旨，秉承佛山市中医院“传承、创新、精诚、奋发”的办院精神，借助佛山市中医院三级甲等中医院的管理模式和经验，加强医院管理和职业道德建设，完善各项管理制度；狠抓业务发展和专科建设，下派专家，增设专家专科门诊，强化特色和优势专科建设，增加住院床位，积极拓展业务，扩大医院的影响力；加强医疗质量管理，提高应急和救治能力；整顿医院诊疗秩序，规范执业行为；重新合理利用和优化现有的卫生资源，实行人事分配制度改革；加大设备设施投入，改善诊疗环境；转变服务理念，提高服务水平；抓好社区卫生服务，完善服务功能；实施“科技兴医”战略，开创工作新局面；实行后勤服务社会化和经济成本管理，努力解决群众看病贵、看病难问题；按现代化医院模式规划新院址，落实新院址改造建设工程等一系列措施，使医院的医疗救治和应急能力明显提高，管理逐渐与总院吻合，并逐渐形成三水分院自身特有的管理模式，社会效益和经济效益明显提高，服务理念和服务水平翻开了新的一页。