上海市精神卫生中心始建于1935年，前身为上海普慈疗养院，院址位于上海市西南郊区（现闵行区），由慈善家陆伯鸿集资建设，属教会管理，是当时远东大、设备完善的精神科专科医院之一。医院占地约100亩，建筑面积约3万平方米。

几十年的风雨历程，如今上海市精神卫生中心已成为上海市三级甲等精神卫生专科医院，担负着全市精神卫生的医疗、教学、、预防、康复、心理咨询/治疗和对外学术交流等任务，是全国规模大、业务种类全、领衔学科多的精神卫生机构。2006年5月，上海市精神卫生中心成为上海交通大学医学院附属医院。

上海市精神卫生中心徐汇院区地处宛平南路600号；闵行院区地处沪闵路3210号。总建筑面积约10万平方米。中心同时也是上海市疾病预防控制精神卫生分中心、上海市精神卫生临床质量控制中心、上海市心理咨询培训中心、国家精神药物临床试验机构、WHO/上海精神卫生研究与培训合作中心。